Si no sabes que son los permisos, o no sabes como ver los permisos de un fichero o una carpeta, te recomiendo que leas este tutorial:
Explicación de los permisos de carpetas y ficheros en GNU/Linux

Cambiar permisos desde la consola
Nos vamos a Aplicaciones -> Accesorios -> Terminal
Por ejemplo yo le quiero dar permisos de lectura, escritura y ejecución para los 3 grupos a una carpeta llamada Prueba que está en el Escritorio, así que navego hasta el escritorio:

cd Escritorio

Y tengo dos opciones,la numérica y la alfabética:

1.- chmod 777 Prueba
2.- chmod rwx Prueba

Si la carpeta pertenece a root, tendremos que hacerlo asi:

1.- sudo chmod 777 Prueba
2.- sudo chmod rwx Prueba

Y meter nuestra password.

Si queremos que se haga de manera recursiva, es decir, que los ficheros y carpetas contenidos en Prueba, también reciban estos cambios, hacemos esto:

1.- chmod -R 777 Prueba
2.- chmod -R rwx Prueba

Cualquiera de las dos y teniendo en cuenta lo de sudo.

Un par de ejemplos más:
Queremos que el usuario tenga RWX, el grupo RW y los demás R, en la carpeta Prueba:

1.- chmod 764 Prueba
2.- chmod u=rwx,g=rw,o=r Prueba

u equivale a usuario (user) g a grupo (group) y o a otros (others). También sirve lo de -R y sudo.

Queremos que el usuario tenga RW, el grupo R y los demás R, en la carpeta Prueba:

1.- chmod 644 Prueba
2.- chmod u=rw go=rw Prueba

Igualmente sirve lo de -R y sudo.

Para quitar permisos, realmente es cambiarlos por otros, asi que es lo mismo que aquí se explica.

En fin, espero que haya quedado más o menos claro.